src/java/org/ufcspa/simdecs/comunicacao/MetodoIniciaCaso.java

   1 /*
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   3  * and open the template in the editor.
   4  */
   5 package org.ufcspa.simdecs.comunicacao;
   6
   7 import java.io.PrintWriter;
   8 import java.util.ArrayList;
   9 import java.util.Date;
  10 import java.util.Iterator;
  11 import java.util.List;
  12 import javax.persistence.EntityManager;
  13 import javax.servlet.http.HttpServletRequest;
  14 import javax.servlet.http.HttpServletResponse;
  15 import org.ufcspa.simdecs.entities.*;
  16 import org.ufcspa.simdecs.util.DbUtil;
  17 import org.ufcspa.simdecs.util.UnBBayesUtil;
  18 import unbbayes.prs.bn.ProbabilisticNode;
  19 import unbbayes.prs.bn.TreeVariable;
  20
  21 /**
  22  *
  23  * @author maroni
  24  */
  25 public class MetodoIniciaCaso extends BaseComunicacao {
  26
  27     private String getPerguntaNodo(Long idNodo) {
  28         EntityManager em = DbUtil.getInstance().getEntityManager();
  29         List <PerguntaNodo> perguntas = em.createQuery("From PerguntaNodo where nodo.id=:pIdNodo")
  30                                          .setParameter("pIdNodo", idNodo)
  31                                          .getResultList();
  32
  33         int random = (int) (1+Math.random()*perguntas.size());
  34         int i=1;
  35
  36         for(PerguntaNodo pergunta : perguntas) {
  37             if (i++ == random)
  38                 return pergunta.getTexto();
  39         }
  40
  41         return "";
  42     }
  43
  44
  45     private String getRespostaNodo(Nodo nodo, Paciente paciente) throws Exception {
  46         EntityManager em = DbUtil.getInstance().getEntityManager();
  47
  48
  49         UnBBayesUtil unBUtil = new UnBBayesUtil(paciente.getRede());
  50         unBUtil.abreRede(paciente.getRede());
  51
  52         Iterator<NodoPaciente> it = em.createQuery("From NodoPaciente Where paciente.id=:pIdPaciente")
  53                                       .setParameter("pIdPaciente", paciente.getId())
  54                                       .getResultList()
  55                                       .iterator();
  56
  57         float pcProbabilidade=0;
  58         while(it.hasNext()) {
  59             NodoPaciente nodoPac = it.next();
  60
  61             if (nodoPac.getNodo().getBogus()) {
  62                 if (nodoPac.getNodo().getId() == nodo.getId())
  63                     pcProbabilidade = 100;
  64
  65                 continue;
  66             }
  67
  68             ProbabilisticNode pn = (ProbabilisticNode) unBUtil.getNodeByName(nodoPac.getNodo().getNome());
  69             unBUtil.setNodeState(pn, "Yes", 1, "Not", 0);
  70         }
  71
  72
  73         if (nodo.getBogus()) {
  74             if (pcProbabilidade == 0)
  75                 pcProbabilidade = (int) (1+Math.random()*50);
  76         }
  77         else {
  78             pcProbabilidade = unBUtil.getProbabilidadeByState((TreeVariable) unBUtil.getNodeByName(nodo.getNome()), "Yes") * 100;
  79         }
  80
  81         // Ajusta os percentuais de probabilidade caso ultrapasse em decimos os extremos
  82         if (pcProbabilidade < 0)
  83             pcProbabilidade = 0;
  84
  85         if (pcProbabilidade > 100)
  86             pcProbabilidade = 100;
  87
  88         List <RespostaNodo> respostas = em.createQuery("From RespostaNodo where nodo.id=:pIdNodo")
  89                                          .setParameter("pIdNodo", nodo.getId())
  90                                          .getResultList();
  91
  92         int random = (int) (1+Math.random()*respostas.size());
  93         int i=1;
  94
  95
  96         for(RespostaNodo resposta : respostas) {
  97             if (i++ == random) {
  98                 List<IntervaloTabelaResposta> listaInt = em.createQuery("From IntervaloTabelaResposta Where tabelaResposta.id=:pIdTabela and :pProbabilidade between pesoMinimo and pesoMaximo")
  99                                                           .setParameter("pIdTabela", resposta.getTabelaResposta().getId())
 100                                                           .setParameter("pProbabilidade", pcProbabilidade)
 101                                                           .getResultList();
 102
 103                 int randomInt = (int) (1+Math.random()*listaInt.size());
 104                 int x=1;
 105                 for(IntervaloTabelaResposta intervalo : listaInt) {
 106                     if (x++ == random) {
 107                         String returnResposta = resposta.getTexto().replaceAll("&&tabela", intervalo.getTexto());
 108
 109                         if (returnResposta.substring(0,1).equals(returnResposta.substring(0,1).toLowerCase()))
 110                             return returnResposta.substring(0,1).toUpperCase() + returnResposta.substring(1);
 111                         else
 112                             return returnResposta;
 113
 114                     }
 115                 }
 116             }
 117         }
 118
 119         return "";
 120     }
 121
 122     private String getDependencia(Long idNodo) {
 123         return "";
 124     }
 125
 126
 127     private void registraPerguntaLog(EntityManager em, SessaoUsuario sessaoUsuario, Paciente paciente, Nodo nodo, boolean ativo, String tipoNodo, String pergunta, String nomeAmigavel, String resposta) {
 128         if (!em.getTransaction().isActive())
 129             em.getTransaction().begin();
 130
 131         LogPerguntas logPerguntas = new LogPerguntas();
 132         logPerguntas.setNodo(nodo);
 133         logPerguntas.setAtivo(ativo);
 134         logPerguntas.setPaciente(paciente);
 135         logPerguntas.setPergunta(pergunta);
 136         logPerguntas.setSessaoUsuario(sessaoUsuario);
 137         logPerguntas.setTipoNodo(tipoNodo);
 138         logPerguntas.setNomeAmigavel(nomeAmigavel);
 139         logPerguntas.setResposta(resposta);
 140
 141         em.persist(logPerguntas);
 142         em.getTransaction().commit();
 143
 144     }
 145
 146
 147     @Override
 148     protected void executaServico(EntityManager em, HttpServletRequest request, HttpServletResponse response, PrintWriter out) throws Exception
 149     {
 150         response.setContentType("text/html;charset=UTF-8");
 151         Caso caso = em.find(Caso.class, Long.parseLong(request.getParameter("idcaso")));
 152
 153
 154         if (!em.getTransaction().isActive()) {
 155             em.getTransaction().begin();
 156         }
 157
 158         // Cria sessao
 159         SessaoUsuario sessaoUsuario = new SessaoUsuario();
 160         sessaoUsuario.setData(new Date());
 161         sessaoUsuario.setCaso(caso);
 162         em.persist(sessaoUsuario);
 163         //em.flush();
 164
 165         // Logo inicio do caso.
 166         Log log = new Log();
 167         log.setTipo(em.find(TipoEventoLog.class, TipoEventoLog.INICIO_CASO));
 168         log.setCaso(caso);
 169         log.setData(new Date());
 170         log.setSessaoUsuario(sessaoUsuario);
 171
 172
 173         em.persist(log);
 174
 175
 176         em.getTransaction().commit();
 177
 178
 179         out.println("<xml>");
 180         out.println("   <caso uid=\"caso-" + clear(caso.getId()) + "\" sessao=\"" + clear(sessaoUsuario.getId()) + "\" titulo=\"" + clear(caso.getNome()) + "\" modelo=\"" + clear(caso.getModelo()) + "\" descricaoAmbiente=\"" + clear(caso.getTextoInicial()) + "\">");
 181
 182         Iterator<Paciente> itPac = em.createQuery("From Paciente where caso.id=:pIdCaso").setParameter("pIdCaso", caso.getId()).getResultList().iterator();
 183         while (itPac.hasNext()) {
 184             Paciente paciente = itPac.next();
 185             out.println("    <ator uid=\"" + clear(paciente.getId()) + "\" tipo=\"paciente\" nome=\"" + clear(paciente.getNome()) + "\" modelo=\"" + clear(paciente.getModelo()) + "\" idade=\"" + clear(paciente.getIdade()) + "\" peso=\"" + clear(paciente.getPeso()) + "\" altura=\"" + clear(paciente.getAltura()) + "\" >");
 186
 187             out.println("        <etapa uid=\"etapa-1\" nome=\"Investigação\" sequencia=\"1\" tipo=\"investigacao\">");
 188
 189             List<String> listaSintomas = new ArrayList<String>();
 190
 191             List<NodoPaciente> nodos = em.createQuery("From NodoPaciente Where paciente.id=:pIDPaciente").setParameter("pIDPaciente", paciente.getId()).getResultList();
 192             for (NodoPaciente nodo : nodos) {
 193                 if (!nodo.getNodo().getTipo().equals(Nodo.SINAL_SINTOMA) && !nodo.getNodo().getTipo().equals(Nodo.HISTORICO)) {
 194                     continue;
 195                 }
 196
 197                 {
 198                     String pergunta = getPerguntaNodo(nodo.getNodo().getId());
 199                     String resposta = getRespostaNodo(nodo.getNodo(), paciente);
 200                     registraPerguntaLog(em, sessaoUsuario, paciente, nodo.getNodo(), true, Nodo.SINAL_SINTOMA, pergunta, nodo.getNodo().getNomeAmigavel(), resposta);
 201                     listaSintomas.add("                <sintoma uid=\"sintoma-np-" + nodo.getId() + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" nomeCientifico=\"" + clear(nodo.getNodo().getNome()) + "\" nomePopular=\"" + clear(pergunta) + "\" imagem=\"\" som=\"\" video=\"\" dependencia=\"" + getDependencia(nodo.getNodo().getId()) + "\" falaPaciente=\"" + clear(resposta) + "\" />");
 202                 }
 203             }
 204
 205             // Sinais e sintomas inativos
 206             List<Nodo> nodosNaoSelecionados = em.createQuery("From Nodo Where rede.id=:pIDRede and id not in (Select nodo.id from NodoPaciente Where paciente.id=:pIDPaciente)").setParameter("pIDRede", paciente.getRede().getId()).setParameter("pIDPaciente", paciente.getId()).getResultList();
 207             for (Nodo nodo : nodosNaoSelecionados) {
 208                 if (!nodo.getTipo().equals(Nodo.SINAL_SINTOMA) && !nodo.getTipo().equals(Nodo.HISTORICO)) {
 209                     continue;
 210                 }
 211
 212                 {
 213                     String pergunta = getPerguntaNodo(nodo.getId());
 214                     String resposta = getRespostaNodo(nodo, paciente);
 215                     registraPerguntaLog(em, sessaoUsuario, paciente, nodo, false, Nodo.SINAL_SINTOMA, pergunta, nodo.getNomeAmigavel(), resposta);
 216                     listaSintomas.add("                <sintoma uid=\"sintoma-nd-" + nodo.getId() + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" nomeCientifico=\"" + clear(nodo.getNome()) + "\" nomePopular=\"" + clear(pergunta) + "\" imagem=\"\" som=\"\" video=\"\" dependencia=\"" + getDependencia(nodo.getId()) + "\" falaPaciente=\"" + clear(resposta) + "\" />");
 217                 }
 218             }
 219
 220             // Randomiza sinais e sintomas
 221             Object[] listaRandom = listaSintomas.toArray();
 222             for(int i=0; i < listaRandom.length; i++) {
 223                 int random = (int) (Math.random()*listaRandom.length);
 224                 Object temp = listaRandom[i];
 225                 listaRandom[i] = listaRandom[random];
 226                 listaRandom[random] = temp;
 227             }
 228
 229             // Sinais e sintomas
 230             out.println("            <perguntar_sintoma uid=\"perguntar-sintoma-" + paciente.getId() + "\" descricao=\"Perguntar Sinais/Sintomas\">");
 231             for(int i=0; i < listaRandom.length; i++) {
 232                 out.println(listaRandom[i]);
 233             }
 234             out.println("            </perguntar_sintoma>");
 235
 236             // Exame Físico
 237             out.println("            <realiza_exame_fisico uid=\"realiza-exame-fisico-" + paciente.getId() + "\" descricao=\"Realizar Exame Físico\">");
 238             for (NodoPaciente nodo : nodos) {
 239                 if (!nodo.getNodo().getTipo().equals(Nodo.EXAME_FISICO)) {
 240                     continue;
 241                 }
 242
 243                 {
 244                     registraPerguntaLog(em, sessaoUsuario, paciente, nodo.getNodo(), false, Nodo.EXAME_FISICO, null, nodo.getNodo().getNomeAmigavel(), null);
 245                     out.println("                <exame_fisico uid=\"exame-fisico-np-" + nodo.getId() + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" dependencia=\"" + getDependencia(nodo.getNodo().getId()) + "\" descricao=\"" + clear(nodo.getNodo().getNomeAmigavel()) + "\" resultado=\"\" imagem=\"\" som=\"\" video=\"\" />");
 246                 }
 247             }
 248             out.println("            </realiza_exame_fisico>");
 249
 250             // Exame Complementar
 251             out.println("            <solicitar_exames_complementar uid=\"solicitar-exame-complementar-" + paciente.getId() + "\" descricao=\"Solicitar Exame Complementar\">\"");
 252             for (NodoPaciente nodo : nodos) {
 253                 if (!nodo.getNodo().getTipo().equals(Nodo.EXAME_COMPLEMENTAR)) {
 254                     continue;
 255                 }
 256
 257                 {
 258                     registraPerguntaLog(em, sessaoUsuario, paciente, nodo.getNodo(), false, Nodo.EXAME_COMPLEMENTAR, null, nodo.getNodo().getNomeAmigavel(), null);
 259                     out.println("                <exame_complementar uid=\"exame-complementar-np-" + nodo.getId() + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" dependencia=\"" + getDependencia(nodo.getNodo().getId()) + "\" descricao=\"" + clear(nodo.getNodo().getNomeAmigavel()) + "\" resultado=\"\" imagem=\"\" som=\"\" video=\"\" />");
 260                 }
 261             }
 262             out.println("            </solicitar_exames_complementar>");
 263             /*
 264              * // historico for(NodoPaciente nodo : nodos) { if
 265              * (!nodo.getNodo().getTipo().equals(Nodo.HISTORICO)) continue;
 266              *
 267              * out.println(" <historico_medico uid=\"historico-medico-" +
 268              * nodo.getId() + "\" dependencia=\"" +
 269              * getDependencia(nodo.getNodo().getId()) + "\"
 270              * descricao=\"Histórico Médico\" historico=\"" +
 271              * nodo.getNodo().getNomeAmigavel() + "\" imagem=\"\" som=\"\"
 272              * video=\"\" />"); }
 273              */
 274             out.println("        <historico_medico uid=\"historico-medico-1" + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" dependencia=\"\" descricao=\"Histórico Médico\" historico=\"" + clear(paciente.getCaso().getTextoInicial()) + "\n\n" +   clear(paciente.getHistorico()) + "\" imagem=\"\" som=\"\" video=\"\" />");
 275
 276
 277             out.println("        </etapa>");
 278
 279             out.println("        <etapa uid=\"etapa-2\" nome=\"Diagnóstico\" sequencia=\"2\" tipo=\"diagnostico\">");
 280             Iterator<Nodo> itDiagnosticos = em.createQuery("From Nodo where tipo=:pTipo").setParameter("pTipo", Nodo.DIAGNOSTICO).getResultList().iterator();
 281             while (itDiagnosticos.hasNext()) {
 282                 Nodo nodo = itDiagnosticos.next();
 283                 {
 284                     String resposta = getPerguntaNodo(nodo.getId());
 285                     registraPerguntaLog(em, sessaoUsuario, paciente, nodo, false, Nodo.DIAGNOSTICO, null, nodo.getNomeAmigavel(), resposta);
 286                     out.println("            <diagnostico uid=\"diagnostico-" + nodo.getId() + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" nome=\"" + clear(nodo.getNomeAmigavel()) + "\" falaMedico=\"" + clear(resposta) + "\" />");
 287                 }
 288             }
 289             out.println("        </etapa>");
 290
 291             out.println("        <etapa uid=\"etapa-3\" nome=\"Conduta\" sequencia=\"3\" tipo=\"conduta\">");
 292             Iterator<Nodo> itConduta = em.createQuery("From Nodo where tipo=:pTipo").setParameter("pTipo", Nodo.CONDUTA).getResultList().iterator();
 293             while (itConduta.hasNext()) {
 294                 Nodo nodo = itConduta.next();
 295                 {
 296                     String resposta = getPerguntaNodo(nodo.getId());
 297                     registraPerguntaLog(em, sessaoUsuario, paciente, nodo, false, Nodo.CONDUTA, null, nodo.getNomeAmigavel(), resposta);
 298                     out.println("            <conduta uid=\"conduta-" + nodo.getId() + ":paciente-" + paciente.getId() + "\" nome=\"" + clear(nodo.getNomeAmigavel()) + "\" falaMedico=\"" + clear(resposta) + "\" />");
 299                 }
 300             }
 301             out.println("        </etapa>");
 302             out.println("    </ator>");
 303         }
 304
 305
 306         out.println("  </caso>");
 307         out.println("  <execucao sucesso=\"sim\" />" );
 308         out.println("</xml>");
 309     }
 310
 311 }